腸内フローラ検査が安いキット比較ランキング7選【2回目以降の価格つき】

腸内フローラ検査が安いキット比較(この記事で分かること)

本記事で確認した7社のうち、価格を公式の文字で確認できたのは4社。
1回の税込価格は19,800円〜38,500円でした。

編集部

2万円前後の価格を見て、申し込む手が止まっていませんか。

腸内フローラは、腸にすむ細菌の集まりのことです。

その状態を自宅で調べるキットを、公式の税込価格で並べました。

2回受けるなら、候補は2つです。
マイキンソーの定期便は1回14,850円で回数の縛りなし。
Flora Scanの2回セットは35,640円です(いずれも税込)。

価格が同じ19,800円でも、2回受けると合計に差が出ます。

スクロールできます
1位 マイキンソー
総合評価
( 5 )

定期便なら1回14,850円(税込)

⇨ 詳細はこちら

2位 Flora Scan
総合評価
( 4.5 )

2回セットは35,640円(税込)

⇨ 詳細はこちら

3位 GUT PARTNER
総合評価
( 4.5 )

送料無料で22,000円(税込)

⇨ 詳細はこちら

4位 健腸ナビ
総合評価
( 4.5 )

送料0円で病気リスクの傾向を分析

⇨ 詳細はこちら

5位 chatFLORA G
総合評価
( 4 )

定期は4つの間隔から選べる

⇨ 詳細はこちら

6位 腸内博士ビューティー エクオールプラス
総合評価
( 4 )

エクオール産生の有無も便で調べる

⇨ 詳細はこちら

7位 ビフィチェック
総合評価
( 3.5 )

善玉菌と悪玉菌のバランスに絞る

⇨ 詳細はこちら

読むと分かる3つのこと

  • 公式の税込価格で並べた7社の安さ
  • 1回の価格と2回目以降の買い方の比べ方
  • 定期便・2回セット・医療機関の違い

扱うのは公式の通常価格と、定期便・2回セットまでです。

編集部

1回だけか、2回受けるか。そこが決まると選びやすくなります。

※価格は2026年10月11日に各公式ページで確認したものです。最新の価格は公式サイトでご確認ください。

目次

腸内フローラ検査が安いキット比較ランキング7選

図解:腸内フローラ検査が安いキット比較ランキング7選

1回の税込価格を公式で確認できたのは7社中4社。幅は19,800円〜38,500円でした。

編集部

1回なら19,800円のマイキンソーかFlora Scan。

2回ならマイキンソーの定期便か、Flora Scanの2回セットで比べましょう。

価格は2026年10月11日に各公式ページで確認した税込価格です。

検査キット1回の税込価格送料と購入条件

1位 マイキンソー
公式サイト
19,800円(税込)定期便は送料無料で回数の縛りなし

2位 Flora Scan
公式サイト
19,800円(税込)医療機関やふるさと納税でも受けられる

3位 GUT PARTNER
公式サイト
22,000円(税込)送料無料で単品購入のみ

4位 健腸ナビ
公式サイト
38,500円(税込)送料0円で18歳未満は購入不可

5位 chatFLORA G
公式サイト
公式サイトで確認定期購入は4つの間隔から選べる

6位 腸内博士ビューティー エクオールプラス
公式サイト
公式サイトで確認全商品送料無料で解約は次回発送の10日前まで

7位 ビフィチェック
公式サイト
公式サイトで確認公式サイトで確認

「総合」の順位は、公式ページの文字で確認できた4項目(1回の税込価格・2回目以降の価格・送料か購入条件・分かること)の数の降順です。根拠は選び方・順位の基準。

順位の基準はこちら。

ランキング外のマイフローラは「安い腸内フローラ検査は目的別にどれがいい?」で、医療機関の価格は「病院やクリニックで受ける場合と比べる」で紹介しています。

1位 マイキンソー|定期便なら1回14,850円

マイキンソー公式ストアの定期便の商品名と販売価格14,850円(税込)・送料無料の表示
出典:マイキンソー公式ストア
1回の税込価格(10月11日確認)19,800円(1回購入)
2回目以降の価格定期便 14,850円(税込)
送料と購入条件定期便は送料無料・回数の縛りなし
分かることやせ菌/肥満菌・菌の多様性・腸内環境の推移など
向いている人1回を試したい人・定期で変化を見たい人

4つの基準すべてを公式の文字で確認できたのは、7社でマイキンソーだけでした。

星5.0の理由は『価格と条件が公式の文字でそろう』点です。

  • 公式ストアの1回購入は19,800円(税込)
  • 定期便は1回14,850円(税込)で、回数の縛りなし
  • 定期便は送料無料で、解約・スキップもできる

定期便は1回14,850円(税込)で、1回購入の19,800円(税込)より安い価格です。

回数の縛りがないため、2回受けてから解約する選び方もできます。

マイキンソーの定期便の条件を公式サイトで見る>>

医療機関向けの「マイキンソープロ」とは別の商品です。検査は腸内の状態を知るためのものです。

  • 価格と定期便の条件を、公式の文字で確かめられる
  • 定期購入に回数の縛りがなく、1回でやめる選び方もできる
  • 1回購入の19,800円は、Flora Scanの1回セットと同じ価格
  • 解約・スキップの期限は、申し込む前に公式ストアの商品ページと利用規約で確かめる
  • 向いている人:1回を試したい人、定期で変化を見たい人
  • 慎重に検討したい人:定期便の解約の連絡を省きたい人
  • 申し込む前に確かめること:解約・スキップの期限と送料
編集部

1回で試すにも続けるにも、条件を公式で読める人に合うキットです。

編集部

1回購入は19,800円(税込)、定期便は1回14,850円(税込)です。

  • 定期便は送料無料
  • 定期購入に回数の縛りなし
  • 1回購入と定期便から選べる

\定期便は1回14,850円/

マイキンソーの詳細を公式サイトで確認する

2位 Flora Scan|2回セットなら35,640円

Flora Scan(フローラスキャン)公式サイトの1回セット19,800円(税込)の価格表示
出典:Flora Scan 公式サイト
1回の税込価格(10月11日確認)1回セット 19,800円
2回目以降の価格2回セット 35,640円(税込)
送料と購入条件送料は申込画面で確認・医療機関でも購入可
分かること腸内フローラのタイプ分類と食事のアドバイス
向いている人2回受けて変化を見たい人

表記は公式どおり「Flora Scan(フローラスキャン)」で、販売はプリメディカです。

星4.5の根拠は、1回・2回セットの価格と分かることの3つを公式で確認できた点です。

強みは『2回分をまとめて買える』ことです。

  • 2回セットは35,640円(税込)で、2回分をまとめて買える
  • お近くの医療機関でも購入できる(費用は各医療機関に問い合わせ)
  • 大阪府枚方市のふるさと納税の返礼品として提供されている

2回セットは定期便ではなく、2回分をまとめて買う形です。

1回セットは19,800円(税込)なので、2回受けると決めている人は2回セットと見比べられます。

Flora Scanの1回・2回セットを公式サイトで見る>>

  • 1回セットと2回セットの価格を、公式で見比べられる
  • 自宅のほか、医療機関やふるさと納税でも受けられる
  • 送料と解約の条件は、確認した公式ページに記載が見当たらない
  • 総額は、販売ページの申込画面で送料まで含めて確かめる
  • 向いている人:2回受けて変化を見たい人、定期便を使いたくない人
  • 慎重に検討したい人:送料まで含めた総額を先に知りたい人
  • 申し込む前に確かめること:申込画面の送料と、2回目の検体の出し方
編集部

2回分をまとめて買い、変化を見たい人に合うキットです。

編集部

1回セットは19,800円(税込)、2回セットは35,640円(税込)です。

  • 1回セットと2回セットから選べる
  • 医療機関でも購入できる
  • 大阪府枚方市のふるさと納税返礼品

\2回セットは35,640円/

Flora Scanの詳細を公式サイトで確認する

3位 GUT PARTNER|送料無料の22,000円

GUT PARTNER の公式ストア(AuB Store)の商品名の表示
出典:GUT PARTNER 公式ストア(AuB Store)
1回の税込価格(10月11日確認)22,000円
2回目以降の価格単品購入のみ(定期の記載なし)
送料と購入条件送料無料(AuB Storeの特定商取引法に基づく表記)
分かること腸内細菌の結果を健康テーマ別のレポートで返す
向いている人1回でテーマ別のレポートを読みたい人

販売元はAuB株式会社(AuB Store)です。価格・送料・分かることの3つを公式で確認でき、星は4.5です。

特徴は『健康テーマ別のレポート』で結果を読める点です。

  • 税込22,000円で、送料は無料
  • 結果は検体の返送後、およそ3〜5週間が目安(公式ページの案内)
  • AuB独自の解析で、腸内細菌の結果をテーマ別にまとめる

商品ページの記載は単品購入のみで、受けるたびに22,000円(税込)がかかります。

2回以上受けるなら、定期便や2回セットのある社と見比べましょう。

GUT PARTNERのレポートの中身を公式サイトで見る>>

レポートには疾患リスクの項目もあります。
診断ではなく、今の腸内の傾向を知るための結果として読みましょう。

  • 送料無料のため、22,000円で総額が読める
  • 結果を健康テーマごとに読み分けられる
  • 2回以上受けると、1回ごとに22,000円がかかる
  • 結果が届くまでの期間は目安のため、急ぐ人は公式で確かめる
  • 向いている人:1回でテーマ別の結果を読みたい人
  • 慎重に検討したい人:2回以上受けて変化を見たい人
  • 申し込む前に確かめること:結果が届くまでの目安と申込画面の価格
編集部

1回で健康テーマ別の結果を読みたい人に合うキットです。

編集部

GUT PARTNERは22,000円(税込)で、送料は無料です。

  • 送料無料
  • 結果を健康テーマ別のレポートで返す
  • 単品購入のみ

\送料無料で22,000円/

GUT PARTNERの詳細を公式サイトで確認する

4位 健腸ナビ|送料0円の38,500円で項目を重視

健腸ナビの検査キット購入ページの商品名・価格38,500円(税込)・送料0円の表示
出典:健腸ナビ 公式サイト
1回の税込価格(10月11日確認)38,500円
2回目以降の価格定期購入の記載なし
送料と購入条件送料0円・18歳未満と国外在住は購入不可
分かること男女別に病気リスクの傾向を分析し食品・成分を提案
向いている人安さより分かる項目を重視する人

販売はシンバイオシス・ソリューションズ株式会社。価格は確認できた4社の中で上の価格帯です。

星4.5は、価格・送料と購入条件・分かることの3つを公式で確認できたためです。

『分かる項目の広さで選ぶ人』のための比較基準として置いています。

  • 税込38,500円で、送料は0円
  • 18歳未満の人と日本国外に住む人は購入できない
  • 腸内フローラ解析と分析モデルで、男女別に病気リスクの傾向を分析する

購入ページに定期購入の記載はなく、受けるたびに38,500円(税込)がかかります。

1回で項目を広く見たい人に向けたキットと考えると、価格の位置づけが分かりやすくなります。

健腸ナビで分かることを公式サイトで見る>>

病気リスクは「傾向の分析」です。
診断や予防の結果ではないため、体調が気になる人は医療機関に相談しましょう。

  • おすすめの食品・成分の提案まで受けられる
  • 送料0円で、38,500円が総額になる
  • 購入ページに定期購入の記載はなく、2回目も38,500円がかかる
  • 年齢と住所の購入条件がある
  • 向いている人:価格より分かる項目を重視する人
  • 慎重に検討したい人:費用を2万円前後に収めたい人
  • 申し込む前に確かめること:購入できる年齢と住所の条件
編集部

価格より、分かる項目の広さで選びたい人に合うキットです。

編集部

健腸ナビは38,500円(税込)で、送料は0円です。

  • 男女別に病気リスクの傾向を分析
  • おすすめの食品・成分を提案
  • 送料0円

\送料0円で38,500円/

健腸ナビの詳細を公式サイトで確認する

5位 chatFLORA G|定期は4つの間隔から選べる

chatFLORA 公式サイトの腸内フローラ検査 chatFLORA G の商品紹介
出典:chatFLORA 公式サイト
1回の税込価格公式サイトで確認(購入ページの価格表示は画像)
2回目以降の価格定期購入なら最大50%OFF(定期購入が条件)
送料と購入条件購入ページで送料無料と案内
定期の間隔4ヶ月ごと・3ヶ月ごと・2ヶ月ごと・毎月
分かること腸内細菌の種類や比率を調べる

販売は株式会社KEAN Healthです。送料と分かることは公式の文字で確認できます。

価格は購入ページで画像のみの表示のため、金額は載せていません。

星は4.0で、強みは『定期の間隔を自分で選べる』点です。

  • 定期の間隔を4ヶ月ごと(年3回)から毎月(年12回)まで4つから選べる
  • 定期購入なら最大50%OFF(最大の割引率で、定期購入が条件)
  • 腸内細菌の種類や比率を調べるマイクロバイオーム検査

割引後の金額は、公式サイトの購入画面で見られます。

年に何回受けるかを先に決めると、間隔の選び方で迷いにくくなります。

chatFLORA Gの定期の間隔を公式サイトで見る>>

公式サイトには「本検査は法令に基づく医療、診療行為ではございません」との注記があります。

  • 受ける間隔を、自分の予定に合わせて選べる
  • 腸内細菌の種類や比率まで調べられる
  • 金額を比べるには、購入画面の税込表示を見る必要がある
  • 割引率は定期購入が条件で、上限の値として示されている
  • 向いている人:定期で続けて、間隔を自分で決めたい人
  • 慎重に検討したい人:申し込む前に金額を文字で比べたい人
  • 申し込む前に確かめること:税込価格・割引の条件・解約の方法
編集部

定期の間隔を自分で決めて続けたい人に合うキットです。

編集部

価格は購入ページの画像で案内されています。最新の表示は公式サイトで確かめてください。

  • 定期の間隔は4ヶ月ごと〜毎月の4択
  • 定期購入なら最大50%OFF
  • 購入ページで送料無料と案内

\定期の間隔を選べる/

chatFLORA Gの詳細を公式サイトで確認する

6位 腸内博士ビューティー エクオールプラス|送料無料

腸内博士の販売ショップの特定商取引法に基づく表記にある「全商品送料無料」の行
引用:Dr.ヘルスケアラボ「特定商取引法に基づく表記」|shop.dr-gene.jp
1回の税込価格公式サイトで確認(LPの価格表示は画像)
送料と購入条件全商品送料無料(特定商取引法に基づく表記)
定期の解約次回発送予定日の10日前までに連絡
分かることエクオール産生の有無など女性の悩みに関わる項目

販売業者はキャンピングカー株式会社(Dr.ヘルスケアラボ)です。送料と分かることは公式の文字で確認できます。

価格はLPで画像のみの表示のため、星は4.0としました。

強みは『エクオールも一緒に調べられる』点です。

  • エクオール産生の有無など、女性の悩みに関わる項目を便から調べる
  • 全商品送料無料(特定商取引法に基づく表記)
  • 定期便の解約は「次回発送予定日の10日前」までにお問合せフォームから連絡

利用規約第10条には「10日前を過ぎますとその次の回からの変更・解約となります」とあります。

止めたい回があるなら、次回発送予定日の10日前より早めの連絡が安心です。

腸内博士で調べる項目を公式サイトで見る>>

金額は、公式サイトの購入画面の税込表示を見てから決めると安心です。

  • 全商品送料無料で、送料を足さずに考えられる
  • 腸内フローラと一緒にエクオールの項目も調べられる
  • 定期便は期限を過ぎると、解約がその次の回からになる
  • 価格は画像の表示のため、購入画面で金額を確かめる
  • 向いている人:腸内フローラと一緒にエクオールも知りたい人
  • 慎重に検討したい人:定期便の連絡の期限を管理しにくい人
  • 申し込む前に確かめること:税込価格と定期便の解約の期限
編集部

腸内フローラと一緒に、エクオールも知りたい人に合うキットです。

編集部

エクオール産生の有無など、女性の悩みに関わる項目を便から調べます。

  • 全商品送料無料
  • エクオール産生の有無を調べる
  • 定期の解約は次回発送予定日の10日前まで

\全商品送料無料/

腸内博士ビューティー エクオールプラスの詳細を公式サイトで確認する

7位 ビフィチェック|善玉菌と悪玉菌のバランスに絞る

ビフィチェック(カラダのものさし)の公式ページにある商品パッケージの画像
出典:カラダのものさし 公式サイト
1回の税込価格公式サイトで確認(公式ページに価格の文字表記なし)
分かること善玉菌と悪玉菌のバランス(便検査・スコアで返す)
向いている人腸内のバランスだけ知りたい人

販売は株式会社ヘルスケアシステムズで、ブランド名は「カラダのものさし」です。

公式の文字で確認できたのは分かることの1つで、星は3.5です。

ほかの6社との違いは『調べる項目を絞った検査』である点です。

  • 善玉菌(ビフィズス菌)と悪玉菌(クロストリジウム菌)のバランスを調べる
  • 便検査の結果をスコアで返す
  • 購入先は公式オンラインショップとAmazon(公式ページのリンク)

価格は公式ページに文字の記載がないため、購入画面で確かめてください。

調べる項目が善玉菌と悪玉菌のバランスに絞られるため、知りたいことが決まっている人に向きます。

ビフィチェックの検査内容を公式サイトで見る>>

  • 知りたいことがバランスだけなら、結果が読みやすい
  • 結果がスコアで返り、数字で受け止められる
  • 価格・送料・定期の有無は、確認した公式ページに文字の記載が見当たらない
  • やせ菌や菌の多様性など、ほかの項目は調べる対象に含まれていない
  • 向いている人:腸内のバランスだけ知りたい人
  • 慎重に検討したい人:やせ菌や菌の多様性まで知りたい人
  • 申し込む前に確かめること:購入画面の税込価格と送料
編集部

項目を絞って、腸内のバランスだけ見たい人に合うキットです。

編集部

善玉菌と悪玉菌のバランスを便検査で調べ、結果をスコアで返します。

  • 善玉菌と悪玉菌のバランスを調べる
  • 結果はスコアで返る
  • 公式オンラインショップで購入できる

\項目を絞って調べる/

ビフィチェックの詳細を公式サイトで確認する

1回19,800円のキットでも、2回目以降の買い方は定期便・2回セット・単品と分かれます。

一覧は「1回の価格と2回目以降の買い方で比べる」にまとめました。

安い腸内フローラ検査は目的別にどれがいい?

図解:安い腸内フローラ検査は目的別にどれがいい?

1回だけなら19,800円のマイキンソーかFlora Scan。
2回ならマイキンソーの定期便かFlora Scanの2回セット、項目重視なら健腸ナビが目安です。

目的ごとに合うキットを、公式の価格や記載とあわせて表にしました。

目的合うキット根拠(公式の価格・記載)
1回だけ受けるマイキンソー/Flora Scanどちらも1回19,800円(税込)
2回受けて変化を見るマイキンソー定期便定期便1回14,850円(税込)・回数の縛りなし
定期を使わず2回分を買うFlora Scan 2回セット2回セット35,640円(税込)
定期の間隔を決めたいchatFLORA G4つの間隔から選べる(価格は公式で確認)
分かる項目を重視する健腸ナビ38,500円・病気リスクの傾向を分析
結果を栄養士に相談したいマイフローラ19,800円・管理栄養士に何度でも無料で相談
エクオールも知りたい腸内博士エクオール産生の有無を調べる(価格は公式で確認)

Flora Scanのセット価格を公式サイトで比べる>>

編集部

迷ったら、何回受けるかを先に決めましょう。

回数が決まると、候補は1〜2社に絞れます。

健診のオプションで受けたい人は、「病院やクリニックで受ける場合と比べる」の表で医療機関の価格を確かめてください。

1回だけならマイキンソーかFlora Scan

2社とも1回の税込価格は19,800円で同額です(2026年10月11日に公式で確認)。

同じ価格なので、選び分けの基準は分かることの違いです。

2社の違いをさらに詳しく見たい人は、Flora Scanとマイキンソーの目的別の比較も参考になります。

項目マイキンソーFlora Scan
1回の税込価格19,800円1回セット19,800円
分かることやせ菌/肥満菌・菌の多様性などタイプ分類と食事のアドバイス
送料の記載定期便ページに送料無料公式ページに記載なし

送料無料の記載は、マイキンソーの定期便ページで確認できました。

Flora Scanは確認した公式ページに送料の記載がないため、申込画面で送料を確かめると安心です。

2回受けるならマイキンソー定期便か2回セット

マイキンソーの定期便は、1回14,850円(税込)で、1回購入の19,800円(税込)より安い価格です。

回数の縛りはありません。ただし、2回目が届いたあとに解約の手続きが要ります。

項目マイキンソー定期便Flora Scan 2回セット
公式の税込価格1回14,850円2回セット35,640円
買い方定期便・回数の縛りなし2回分をまとめて買う
解約の連絡やめるときに必要定期便ではない

解約・スキップの期限の日数は、申し込む前に公式ストアで確かめましょう。

Flora Scanの2回セットは35,640円(税込)で、2回分をまとめて買う形です。

2回セットは定期便ではないため、解約の手続きが要らない買い方です。

どちらも公式価格の範囲で選べます。分かれ目は「解約の連絡をしたくないか」です。

項目を重視するなら健腸ナビ

健腸ナビは、送料0円の38,500円(税込)で受けられる検査です。

男女別に病気リスクの傾向を分析し、おすすめの食品・成分を提案します。

1回19,800円(税込)のキットより高い価格帯です。
1回で広い項目を見たい人は、価格を項目の広さと比べて判断できます。

病気リスクは傾向の分析で、診断ではありません。

なお、18歳未満の人と日本国外に住む人は購入できません。

栄養士に相談したいならマイフローラ

カルピス健康通販のマイフローラは、19,800円(税込)で送料無料です。

結果について管理栄養士に何度でも無料で相談できます(公式LP・2026年10月11日に確認)。

  • 対象年齢は満16歳以上
  • 返送後、約6週間以内に結果が郵送で届く

公式ページには、医療行為ではなく診断・治療・予防を目的としない旨の注記があります。

本記事のランキングには入れず、参考として紹介しています。

安い腸内フローラ検査の比べ方と順位の基準

図解:安い腸内フローラ検査の比べ方と順位の基準

安さは1回の価格だけで決まりません。2回目以降の買い方と送料・購入条件まで並べると比べやすくなります。

編集部

2回以上受けるなら、定期便やセットの有無まで見て比べましょう。

総合で選びたい人は、腸内フローラ検査キットのおすすめランキングも参考にしてください。

1回の価格と2回目以降の買い方で比べる

公式の税込価格と、2回目以降を下げる買い方の有無を並べました(2026年10月11日に確認)。

キット1回の税込価格2回目以降の買い方と送料
マイキンソー19,800円定期便1回14,850円
送料:定期便は無料
Flora Scan1回セット19,800円2回セット35,640円
送料:公式ページに記載なし
GUT PARTNER22,000円単品購入のみ
送料:無料
健腸ナビ38,500円定期購入の記載なし
送料:0円
マイフローラ(参考)19,800円公式サイトで確認
送料:無料
chatFLORA G・腸内博士・ビフィチェック公式サイトで確認公式サイトで確認
送料:公式サイトで確認

マイキンソーの定期便は、回数の縛りがない買い方です。

Flora Scanの2回セットは、2回分をまとめて買う形です。

GUT PARTNERと健腸ナビは、受けるたびに1回の価格がかかります。

1回の価格が同じ19,800円でも、2回目以降の買い方は社ごとに違います。
2回受けるなら、定期便は14,850円×2回です。2回セットは35,640円、単品は1回の価格×2回になります。

送料と購入条件まで含めて比べる

送料無料の記載を公式の文字で確認できたのは、次の4社です。

キット公式の記載確認したページ
マイキンソー送料無料定期便の商品ページ
GUT PARTNER送料:無料特定商取引法に基づく表記
健腸ナビ送料個別 ¥ 0購入ページ
腸内博士全商品送料無料特定商取引法に基づく表記

chatFLORA Gも、購入ページで送料無料と案内しています。

Flora Scanとビフィチェックは、確認した公式ページに送料の記載が見当たりません。申込画面で確かめましょう。

購入条件の例は、健腸ナビの「18歳未満・国外在住は購入不可」です。

参考に挙げたマイフローラは、対象年齢を満16歳以上としています。

定期や解約の条件の一覧は、「腸内フローラ検査を安い価格で受ける方法」の点検表で確かめられます。

星は公式に明記のある項目の数で決める

キット星公式の明記
マイキンソー5.0明記あり:1回の価格・2回目以降の価格・送料と購入条件・分かること
明記なし:なし
Flora Scan4.5明記あり:1回の価格・2回目以降の価格・分かること
明記なし:送料と購入条件
GUT PARTNER4.5明記あり:1回の価格・送料と購入条件・分かること
明記なし:2回目以降の価格
健腸ナビ4.5明記あり:1回の価格・送料と購入条件・分かること
明記なし:2回目以降の価格
chatFLORA G4.0明記あり:送料と購入条件・分かること
明記なし:1回の価格・2回目以降の価格
腸内博士4.0明記あり:送料と購入条件・分かること
明記なし:1回の価格・2回目以降の価格
ビフィチェック3.5明記あり:分かること
明記なし:1回の価格・2回目以降の価格・送料と購入条件

基準は4つです。1回の税込価格・2回目以降を下げる価格・送料か購入条件・分かることの記載を見ます。

公式の文字で確認できた数が4つで5.0・3つで4.5・2つで4.0・1つで3.5です。

同点は1回の税込価格が安い順、価格を書けない社は公式に書かれた情報が多い順に並べました。

編集部

基準で迷ったら、1位から順に見ていけば十分です。

2026年10月11日に確認した公式ページの記載にもとづく、編集部の整理です。

腸内フローラ検査を安い価格で受ける方法

図解:腸内フローラ検査を安い価格で受ける方法

公式の仕組みで価格を下げる方法は、定期便と2回セットです。医療機関では、診察料などが別にかかる場合があります。

本記事で確認した7社のうち、公式に価格を下げる仕組みがあるのは3社でした。

ただし、定期便は続け方や解約の条件まで見ないと、安さを判断できません。

安く見える条件の点検表

各社の公式ページで確認できた内容を並べました。2026年10月11日に確認した記載です。

キット安くなる仕組み続ける回数・解約の記載
マイキンソー定期便 1回14,850円(税込)回数の縛りなし・次回お届け予定日の前に解約可
Flora Scan2回セット 35,640円(税込)セット購入(定期の記載なし)
GUT PARTNER単品購入のみ定期の記載なし
健腸ナビ定期購入の記載なし定期の記載なし
chatFLORA G定期購入なら最大50%OFF確認した公式ページに解約の記載なし
腸内博士ショップ規約に定期購入の定めあり次回発送予定日の10日前までに連絡
ビフィチェック確認した公式ページに記載なし確認した公式ページに記載なし

送料の記載は次のとおりです。

  • マイキンソー:定期便は送料無料
  • Flora Scan:確認した公式ページに記載なし
  • GUT PARTNER:送料無料
  • 健腸ナビ:送料0円
  • chatFLORA G:購入ページで送料無料と案内
  • 腸内博士:全商品送料無料
  • ビフィチェック:確認した公式ページに記載なし

1回の価格と2回目以降の買い方の一覧は「安い腸内フローラ検査の比べ方と順位の基準」にまとめています。

編集部

定期便は、安さと一緒に「やめ方」も確かめてから選ぶのが安心です。

定期便で2回目以降の価格を下げる

マイキンソー公式ストアの定期便の商品ページ。定期購入に回数の縛りがない旨の表示
引用:マイキンソー公式ストア「【定期便】自宅でできる腸内フローラ検査『マイキンソー』」(株式会社サイキンソー)|store.mykinso.com

マイキンソーの定期便は、1回14,850円(税込)です。

公式ストアの定期便ページには、送料無料で「定期購入に回数の縛りはございません」とあります。

定期便の14,850円(税込)は、1回購入の19,800円(税込)より安い価格です。

買い方税込価格公式の条件
1回購入19,800円1回だけ購入
定期便1回14,850円送料無料・回数の縛りなし

2回受けるなら、2回とも定期便の価格で受けられます。

解約とスキップは、次回お届け予定日の前に手続きできます。

期限の日数は、公式ストアの商品ページと利用規約で事前に確かめましょう。

ほかに定期購入の記載がある2社

  • chatFLORA G(定期購入なら最大50%OFF。割引後の金額は公式サイトで確認)
  • 腸内博士(定期購入の価格は公式サイトで確認)

chatFLORA G の定期の間隔は、4ヶ月ごと・3ヶ月ごと・2ヶ月ごと・毎月の4つから選べます。

4ヶ月ごとなら年3回、毎月なら年12回の検査です。

検体の採り方から結果が届くまでの様子は、chatFLORA Gを実際に使ってみた体験記録で紹介しています。

腸内博士の定期便は、次回発送予定日の10日前までに連絡が必要です。10日前を過ぎると、その次の回からの解約になります。

この期限は、販売元ショップの特定商取引法に基づく表記に書かれています。

同じ内容はショップの利用規約第10条にもあります。

定期便の安さは、やめるときの手続きまで含めて見ましょう。

手続きの確かめ方は「安い腸内フローラ検査を申し込む前の注意点」で扱います。

腸内博士の販売ショップの特定商取引法に基づく表記。定期便の解約は次回発送予定日の10日前までに連絡する旨
引用:Dr.ヘルスケアラボ「特定商取引法に基づく表記」|shop.dr-gene.jp

2回セットで2回分をまとめて買う

Flora Scan(フローラスキャン)の2回セットは、35,640円(税込)です。

セット税込価格買い方
1回セット19,800円1回分を買う
2回セット35,640円2回分をまとめて買う

2回受けると決めているなら、1回セットと2回セットの公式価格を見比べましょう。

2回セットは、2回分をまとめて買う形です。定期便のように、次回分を止める連絡を気にせずに済みます。

2回目の検体をいつ出すかは、公式の案内で確かめておきましょう。

編集部

本記事の7社で、2回セットの公式記載があるのは Flora Scan だけでした。

変化を見たいけれど定期便は避けたい人に向く買い方です。

Flora Scan は、大阪府枚方市のふるさと納税の返礼品としても提供されています(公式サイトの記載)。

割引クーポンの情報は、腸内フローラ検査キットのクーポン情報にまとめています。

Flora Scan 公式サイトの2回セット35,640円(税込)の価格表示
引用:腸内フローラ検査Flora Scan(フローラスキャン)公式サイト(株式会社プリメディカ)|flora-scan.jp

病院やクリニックで受ける場合と比べる

医療機関の検査は、自宅キットと価格が近い例があります。違いは検査代以外の費用です。

2026年10月11日に各公式ページで確認した例を並べました(価格は税込)。

受け方税込の価格検査代以外の費用
自宅キット(マイキンソー・Flora Scan)19,800円送料は購入先の表示で確認
春日クリニック18,700円健康保険の対象外・全額窓口精算
山下病院18,700円(検査キット+管理栄養士指導料)保険診療の診察料が別途
しばじクリニック22,000円(マイキンソープロ)確認した料金表は検査費用のみ
  • 自宅キット:公式ストア・公式サイトで購入
  • 春日クリニック:日本在住16歳以上・検体は受診日から2カ月後必着
  • 山下病院:Mykinso Gut を使用
  • しばじクリニック:医療機関向けの別商品

医療機関では、検査代のほかに診察料や指導料がかかる場合があります。総額は受ける施設の最新の案内で確かめましょう。

しばじクリニックで扱うマイキンソープロは、市販のマイキンソーとは別の商品です。

Flora Scan も医療機関で購入できます。費用は各医療機関に問い合わせる形です。

編集部

検査代だけなら差は小さいので、診察料まで含めた総額で比べましょう。

山下病院の腸内フローラ外来の検査費用。検査キットと管理栄養士指導料で18,700円(税込)
引用:医療法人 山下病院「腸内細菌外来(腸内フローラ外来)」|yamashita-hp.jp

安い腸内フローラ検査で分かることの範囲

図解:安い腸内フローラ検査で分かることの範囲

分かることは、価格の順に並ぶとは限りません。

公式に書かれた検査内容と価格を並べ、自分に要る項目で選ぶのが払いすぎない近道です。

価格帯と分かることの対応表

2026年10月11日に各公式ページで確認した記載です。マイフローラは参考として載せています。

キット(税込価格)公式に書かれた検査内容結果の返し方・サポート
ビフィチェック(価格は公式サイトで確認)善玉菌と悪玉菌のバランス結果をスコアで返す
マイキンソー(19,800円)やせ菌/肥満菌・菌の多様性など6項目公式サイトで確認
Flora Scan(19,800円)腸内フローラのタイプ分類食事のアドバイス
マイフローラ(19,800円・参考)腸内フローラ検査(満16歳以上)管理栄養士に何度でも無料で相談
GUT PARTNER(22,000円)腸内細菌の結果を健康テーマ別にまとめるレポートは返送後およそ3〜5週間が目安
健腸ナビ(38,500円)男女別に病気リスクの傾向を分析おすすめの食品・成分を提案
chatFLORA G(価格は公式サイトで確認)腸内細菌の種類や比率統計データに基づき疾患の罹患リスクや体質等を示す
腸内博士(価格は公式サイトで確認)エクオール産生の有無など女性の悩みに関わる項目公式サイトで確認

この表は公式に書かれた検査内容の比較です。精度の優劣を示すものではありません。

解析の方法も、キットによって異なります。16S rRNA解析は、菌の遺伝子の一部を読んで種類を調べる方法です。

編集部

知りたい項目が決まれば、必要以上に高いキットを選ばずに済みます。

項目を絞ったビフィチェックで分かること

ビフィチェックは、調べる項目を腸内のバランスに絞った検査です。

公式ページによると、善玉菌(ビフィズス菌)と悪玉菌(クロストリジウム菌)のバランスを便検査で調べます。

結果はスコアで返ってきます。腸内のバランスだけを知りたい人に向く検査です。

確認した公式ページには、価格の文字表記が見当たりませんでした。

金額は、購入先の画面に表示される税込価格が基準になります。

カラダのものさし公式オンラインショップのビフィチェック商品ページ
引用:カラダのものさし 公式オンラインショップ|karadano-monosashi.jp

2万円前後のキットで分かること

19,800円から22,000円の価格帯には、4つのキットが並びます。

マイキンソーは、公式ストアの定期便ページに次の6項目を挙げています。

  • やせ菌/肥満菌
  • 腸フローラの良し悪し
  • 菌の多様性
  • 主要な菌の割合
  • 腸内の菌構成
  • 腸内環境の推移

Flora Scan は、腸内フローラのタイプ分類と食事のアドバイスが受けられる検査です。

GUT PARTNER は、腸内細菌の結果を健康テーマ別のレポートで返します。

GUT PARTNER の結果は、検体の返送後およそ3〜5週間が目安です。

マイフローラは、管理栄養士に何度でも無料で相談できるサービスがあります。

公式LPには、医療行為ではなく診断・治療・予防を目的としない旨の注記があります。

編集部

同じ2万円前後でも、分かることとサポートの書き方はそれぞれ違います。

結果を食事に生かしたいのか、項目を見たいのかで選び分けましょう。

38,500円の健腸ナビで増えること

健腸ナビは38,500円(税込・送料0円)の検査です。

腸内フローラ解析と分析モデルで、男女別に病気リスクの傾向を分析します。

分析の結果から、おすすめの食品・成分を提案してくれます。

示されるのは病気リスクの「傾向」です。体調や症状に不安がある人は、医療機関に相談しましょう。

2回受けて変化を見る買い方と、公式の価格・条件を並べました(2026年10月11日に確認)。

項目健腸ナビマイキンソー定期便
税込価格38,500円1回14,850円
買い方定期購入の記載なし回数の縛りなし
分かること男女別の病気リスクの傾向菌の多様性・腸内環境の推移など

1回で病気リスクの傾向まで見たい人は、2回受ける買い方と比べてから選ぶと納得しやすくなります。

健腸ナビは、18歳未満の人と日本国外に住む人は購入できません。

編集部

変化を見たいなら2回、1回で病気リスクの傾向まで見たいなら健腸ナビ。

何を知りたいかを先に決めましょう。

健腸ナビの検査キット購入ページ。税込38,500円・送料0円と、18歳未満は購入できない旨の注記
引用:健腸ナビ「『健腸ナビ』検査キット」購入ページ|kenchonavi.com

安い腸内フローラ検査を申し込む前の注意点

図解:安い腸内フローラ検査を申し込む前の注意点

定期便の解約条件・価格の期限・送料を公式で確かめれば、申し込んだ後の想定外の出費を防げます。

安く見える価格ほど、条件は価格の外に書かれています。

申し込む前に確かめる4つのこと

  • 定期便の回数と解約の条件
  • 価格に期限があるかどうか
  • 画像だけの価格は申込画面の金額
  • 検査結果は診断ではないこと

4つとも、公式ページと申込画面の文字で確かめられます。

編集部

安さの条件は、申込画面で最後に確かめるのが確実です。

税込の金額と、定期購入かどうかの表示を見てから進みましょう。

定期便は回数と解約の条件を確かめる

定期便は、1回購入より1回あたりの価格を抑えやすい買い方です。

その代わり、やめるときは自分で解約の手続きをします。

マイキンソーの定期便は、「定期購入に回数の縛りはございません」と案内されています。

次回お届け予定日の前であれば、解約やスキップができます。

期限の日数は、公式ストアの商品ページと利用規約の両方で確かめておきましょう。

腸内博士の販売ショップは、解約の連絡を次回発送予定日の10日前までと定めています。

連絡はマイページか、お問合せフォームから行います。

10日前を過ぎると、その次の回からの解約になります。

止めたい回があるなら、次回発送予定日の10日前を目安に早めに連絡しましょう。

この期限は、ショップの「特定商取引法に基づく表記」にも書かれています。

chatFLORA Gは「定期購入なら最大50%OFF」と案内しています。

割引は定期購入が条件で、お届けの間隔は4つから選ぶ形です。

解約の条件は、申込画面の表示で確かめてから定期購入を選びましょう。

キット定期の記載解約の連絡
マイキンソー回数の縛りなし次回お届け予定日の前まで
腸内博士ショップ規約に定めあり次回発送予定日の10日前まで
chatFLORA G間隔は4つから選ぶ申込画面で確認

国民生活センターは、注文前に「最終確認画面」の表示をよく確認するよう呼びかけています。

困ったときは、消費者ホットライン「188(いやや!)」で近くの消費生活センター等を案内してもらえます。

国民生活センターの発表情報。インターネット通販では注文する前に最終確認画面の表示をよく確認するよう呼びかける部分
引用:国民生活センター「その申込み、定期購入になっていませんか?もう一度『最終確認画面』をチェック!」|kokusen.go.jp

期間限定の価格は期限を確かめる

公式サイトには、期限つきの価格やキャンペーンが表示されることがあります。

その場合は、申込画面の現在の価格と期限を見比べてから申し込みましょう。

  • 表示されている価格の期限
  • 期限が切れたあとの通常価格
  • 定期購入が条件かどうか

本記事の価格は、各社の通常価格と定期便・2回セットの価格です。

定期便の14,850円と2回セットの35,640円は、確認した公式ページに期限の表記がありません。

期限を過ぎると同じ価格で申し込めるとは限らないため、『期限』の表示を見てから進みましょう。

価格が画像だけのキットは公式で確かめる

3社の価格の表示を、公式ページで確認した形で並べました。

キット公式ページの価格の表示金額を確かめる場所
chatFLORA G購入ページで画像のみ公式サイトの購入画面
腸内博士LPで画像のみ公式サイトの購入画面
ビフィチェック確認した公式ページに文字表記なし公式オンラインショップの購入画面

この3社の価格は、公式サイトの最新の表示が基準です。

画像の数字は、読み違いが起きやすい表示です。

『申込画面の税込表示』で金額を確かめてから進みましょう。

検査結果は診断ではないと理解する

chatFLORA の公式サイトの注記。本検査は法令に基づく医療・診療行為ではない旨と、疾患リスクの示し方の説明
引用:chatFLORA 公式サイト|chatflora.jp

自宅で受ける腸内フローラ検査の結果は、医師の診断とは別のものです。

chatFLORAは「本検査は法令に基づく医療、診療行為ではございません」と注記しています。

疾患のリスクも「統計データに基づき、疾患の罹患リスクや体質等を示すもの」と説明しています。

マイフローラも、医療行為ではなく診断・治療・予防を目的としない旨を記載しています。

健腸ナビの病気リスクも、傾向を分析するものとして案内されています。

体調が気になる人や症状がある人は、検査キットの結果を待たずに医療機関へ相談してください。

編集部

キットに迷ったら、1位のマイキンソーから比べるのも1つの方法です。

1回購入と定期便のどちらでも申し込めます。

1回だけでも定期便でも申し込めるため、受ける回数を決めきれない人も選びやすいキットです。

  • 1回購入は19,800円(税込)
  • 定期便は1回14,850円(税込)
  • 定期購入に回数の縛りはなし

\定期便は送料無料/

マイキンソーの公式サイトはこちら

安い腸内フローラ検査のよくある質問と回答

申し込みの前に出やすい『6つの疑問』に、公式ページで確かめた事実で答えます。

安い腸内フローラ検査キットでも結果は信頼できますか?

精度の優劣は、価格だけでは判断できません。価格の差は、検査内容・レポート・相談の有無の差として公式で確かめましょう。

検査そのものに意味があるのか迷う人は、腸内フローラ検査が「意味ない」と言われる理由も読んでみてください。

なお、chatFLORAやマイフローラは医療行為ではない旨を公式に記載しています。価格帯ごとの違いは「安い腸内フローラ検査で分かることの範囲」で比べられます。

腸内フローラ検査は病院と自宅キットのどちらが安い?

本記事で確認した自宅キットの1回購入は、19,800円(税込)からでした(2026年10月時点)。医療機関の例は18,700円〜22,000円で、診察料が別にかかる場合があります。

健腸ナビのコラム(2026年6月公開)は、自宅検査の目安を「2万〜4万円程度」としています。病院・クリニックは「2万〜6万円程度」です。

腸内フローラ検査に保険は使えますか?

春日クリニックの腸内細菌検査の案内には、健康保険の対象外と書かれています。きたやま胃腸肛門クリニックも「保険外診療[自費]」と記載しています。

扱いは施設によって書き方が違うため、受ける医療機関の案内で確かめてから予約しましょう。

定期便で申し込むと途中でやめられますか?

マイキンソーの定期便は回数の縛りがなく、次回お届け予定日の前なら解約やスキップができます。期限の日数は公式ストアで確かめてください。

腸内博士の販売ショップは、次回発送予定日の10日前までに連絡する決まりです。ほかの社の条件は「定期便は回数と解約の条件を確かめる」で整理しています。

尿で調べる安い検査と腸内フローラ検査は同じ?

別の検査です。便で受ける腸内フローラ検査は、腸内細菌のバランスや構成を調べます。

尿の検査は、尿中の物質を測るものです。カラダのものさしのコラムでは、尿中の「インドキシル硫酸」を測定すると紹介しています。

尿で調べる検査の例は、カラダのものさし腸活チェックの検証記事で取り上げています。

腸内フローラ検査は何回受ければよいですか?

回数は、1回の状態を知りたいのか、変化を見たいのかで変わります。変化を見たい人向けに、Flora Scanには2回セット、マイキンソーには定期便が用意されています。

安いキットで決めきれないときの別の道

定期購入で困ったら

解約や請求で困ったときは、消費者ホットライン188で近くの相談窓口を案内してもらえます。

消費者ホットラインの案内(消費者庁)を見る

腸の不調が気になるなら

大腸がん検診は便を調べる検診です。対象年齢や受け方は公的な案内で確かめられます。

大腸がん検診の案内(国立がん研究センター)を見る

症状があるなら医療機関へ

おなかの痛みや便の異常が続くときは、検査キットより先に医療機関を受診しましょう。

安い腸内フローラ検査の最終チェックと早見表

税込価格・2回目以降の買い方・送料・定期の解約条件を確かめてから、公式で申し込みましょう。

選ぶキットが決まったら、申し込む直前に『5つの項目』を見直します。

申し込み前に確かめる5項目

申し込み前の5項目
  • 税込価格と、その価格を確かめた時点
  • 2回目以降の買い方(定期便は解約の手続きも含めて)
  • 送料がかかるかどうか
  • 年齢や住所などの購入条件
  • 定期の回数と解約の期限

例えば健腸ナビは、18歳未満の人と日本国外に住む人は購入できません。

1つでも分からない項目があれば、公式の申込画面で最新の価格と条件を確かめてから申し込みましょう。

編集部

5項目を確かめておけば、届いてから条件に驚く心配を減らせます。

目的別の早見表で1つに決める

目的が決まっている人は、早見表の公式サイトから申込画面へ進めます。

目的をまだ決めきれない人は、6つの質問で重視する軸を整理できる腸内フローラ検査キット診断も使えます。

目的キット公式リンク
1回だけ安く受けたいマイキンソー公式サイト
2回まとめて受けたいFlora Scan公式サイト
健康テーマ別のレポートで見たいGUT PARTNER公式サイト
分析の項目を重視したい健腸ナビ公式サイト
エクオール産生も調べたい腸内博士公式サイト

価格と条件は変わることがあります。申し込む前に、各公式サイトの最新の表示を確かめてください。

※本記事の情報は2026年10月時点のものです。最新の情報は各公式サイトでご確認ください。

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本記事の執筆者

腸内フローラ検査キットを実際に使い比べた経験をもとに、検査の選び方・結果の読み解き方をわかりやすく発信しています。掲載情報は管理栄養士・消化器内科医の監修を受け、正確性を担保しています。「検査を受けてみたいけど、どれを選べばいいかわからない」といった疑問に、データと実体験の両面から答えるメディアです。

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