腸内フローラ検査とダイエット｜やせ菌・肥満菌の見方と検査別の違い

腸内フローラ検査が示すのは『体型に関係するとされる菌の割合』です。体重を変える検査ではありません。

編集部で、検査会社が公開する結果見本と案内を読み比べました。

見本は2025年作成と2018年作成の2つ。項目の中身は同じではありません。

マイキンソーの自宅キットは19,800円(税込)です。

結果が見られるのは、検体がラボに着いて約3〜4週間後です。

この記事で分かること
・体型に関する項目名と数値の見方。
・検査別の項目の違いと作成年。
・料金、結果までの日数、採便の注意。

※2026年10月時点の公式ページと結果見本をもとに、編集部で整理しています。

腸内フローラ検査でダイエットに関わる何が分かる？

分かるのは『体型に関係するとされる菌の割合』です。体重の変化は分かりません。

マイキンソーの2025年作成の見本では、結果は割合(%)で表示されます。

分かることと分からないことを、表にまとめました。

観点	分かること	分からないこと	根拠
体型に関する項目	やせ菌・肥満菌の割合(%)	体重の変化の保証	2025年作成の見本
判定	良好など3段階のラベル	疾患の診断や治療	見本の表紙の注意書き
改善アドバイス	食事や運動の見直しの方向	菌叢や症状の改善の保証	見本の表紙の注意書き
総合判定	A〜Eの5段階	医師の指示に優先する判断	見本の表紙の注意書き

「分かること」の列が、検査で見られる範囲です。

「分からないこと」の列は、見本が保証していない範囲です。

分かるのは体型に関係するとされる菌の割合

マイキンソーの公式ページは、「やせ菌」と「肥満菌」の指標を挙げています。

菌の割合から、体質の傾向を数値で確認する検査です。

説明は「BMIが低い人に多く高い人に少ない傾向がある」という傾向の話です。

見本の結果欄には、次の4つが並びます。

• 項目ごとの結果(割合)
• 前回・前々回の結果
• 良好とされる判定値
• 要改善・改善の余地あり・良好のラベル

各菌の結果は「今回検出されたあなたの腸内細菌全体に対する割合」で示されます。

体重の変化を約束する検査ではない

見本の表紙には、検査結果と改善アドバイスについて「菌叢改善や症状改善を保証するものではありません」とあります。

結果を見ただけで、体重が動くとは言えません。食事を見直すヒントとして使う検査です。

同じ見本は、検査を『生活習慣を見直すためのヘルスケアチェック』と位置づけています。

検査の見本に書かれている注意書き

マイキンソーの2025年作成の見本には、表紙に3つの注意書きがあります。

• 「特定の疾患の診断や治療に直結するものではありません」
• 「菌叢改善や症状改善を保証するものではありません」
• 基礎疾患や気になる症状がある場合は、「医療機関を受診のうえ、医師の指示を優先してください」

結果が気になるときは、見本の注意書きどおり医療機関への相談を優先してください。

見本の全文は、マイキンソーの結果見本(PDF)で確認できます。

腸内フローラ検査の痩せ菌(やせ菌)と肥満菌とは？指す菌の違い

『やせ菌の指す菌は、見本の作成年で違う』という点が、いちばん大事です。

2025年作成の見本は、クリステンセネラをやせ菌としています。

2018年作成の見本は、別の菌や比率を並べています。

呼び名と菌の対応を、表にしました。

呼び名	指す菌	出典
2025年作成の見本のやせ菌	クリステンセネラ	結果見本(2025年2月作成)
2025年作成の見本の肥満菌	フソバクテリウム・ステレラ・メガスファエラ	結果見本(2025年2月作成)
2018年作成の見本	FB比、アッカーマンシア属、クリステンセレラ属	旧版の結果見本(2018年12月作成)
研究論文(2014年)	クリステンセネラ科	Goodrichほか、Cell

見本の作成年が違うと、並ぶ項目も違います。

2025年作成の見本のやせ菌と肥満菌

2025年2月作成の見本では、「やせ菌」の菌内訳(属レベル)はクリステンセネラです。

「肥満菌」は、フソバクテリウム、ステレラ、メガスファエラの3つが並びます。

見本の分類
・有用菌:やせ菌など(腸内に十分保有していることが望ましい菌)
・要注意菌:肥満菌など(腸内には多すぎないほうが望ましい菌)

結果は割合(%)で出て、前回・前々回の欄もあります。

この見本は、Mykinso Pro V4のものです。

自宅版とプロ版の違いは、別の記事で整理しています。

自宅向けの通常版が同じ画面かは、確認した公式ページからは分かりませんでした。

2018年作成の見本はFB比とアッカーマンシア属が中心

2018年12月作成の旧版見本は、項目が違います。

• 太りやすさ(FB比)
• 高FP食(高食物繊維・高タンパク質食)との相性
• アッカーマンシア属の有無
• クリステンセレラ属の有無

FB比は「痩せ体型の人ではFB比が低く、肥満体型の人でFB比が高いという研究報告があります」と説明されています。

アッカーマンシア属は、見本の中で「痩せ菌」と呼ばれることもある菌として紹介されています。

2018年作成の見本の項目は、2025年作成の見本の個別注目菌の表とは並びが違います。

研究で言われていることとまだ分からないこと

2014年の論文は、英国の双子の研究です。1,000を超える便検体を調べています。

クリステンセネラ科は、BMIの低い人に多かった。

• この菌は、遺伝の影響を強く受ける菌として報告されています
• 肥満に関連する腸内細菌叢にクリステンセネラ科の菌を加えたマウスの実験では、体重増加が小さくなりました

マウスの結果を、ヒトにそのまま当てはめることはできません。

出典はGoodrichほか(2014)、Cellです。

理化学研究所の2023年の発表は、Fusimonas intestiniという菌の研究です。

市販検査の「肥満菌」の項目とは、別の菌です。

研究で言えること
・クリステンセネラ科はBMIの低い人に多かったという報告
・マウスの実験では体重増加が小さかった
・どの菌がどう関わるかは、研究が続いている

発表は、どの腸内細菌がどのように肥満・糖尿病を悪化させるかが「明らかになっていませんでした」と述べています。

詳しくは理化学研究所のプレスリリースをご覧ください。

腸内フローラ検査でダイエットに関わる項目を検査別に整理

検査別に見ると、『体型に関する項目の出方は、検査ごとに違います』。

表は、公式の案内や見本に書かれている範囲だけをまとめたものです。

体型に関する項目名	数値の形	判定の出し方	根拠
マイキンソー(自宅キット):やせ菌・肥満菌の指標	確認した公式ページには記載がない	確認した公式ページには記載がない	公式の商品ページ
マイキンソー系の医療機関向け見本:やせ菌・肥満菌	割合(%)と良好とされる判定値	要改善・改善の余地あり・良好	結果見本(2025年2月作成)
SHMCの案内:太りやすさ、やせ菌	案内に記載がない	案内に記載がない	SHMCの案内PDF
東海大学の案内:有用菌(やせ菌など)・要注意菌(肥満菌など)	保有率	案内に記載がない	2022年の案内
Flora Scan:個別の項目名は公式トップに記載がない	善玉菌・悪玉菌の割合	5タイプに分類	公式トップページ
chatFLORA G:レポートの8カテゴリの1つ「ダイエット」	種レベルまで解析	確認した特徴ページには記載がない	公式の特徴ページ

「記載がない」は、確認した公式ページや案内に書かれていないという意味です。

検査によっては、やせ菌という項目名が公式トップに出てこない。

マイキンソーのやせ菌と肥満菌の項目

マイキンソーの公式ページには、「やせ菌」と「肥満菌」の指標が載っています。

公式ページが挙げる、マイキンソーで分かることは次のとおりです。

• やせ菌と肥満菌
• 腸内フローラの良し悪し(A〜Eの5段階)
• 菌の多様性
• 主要な細菌の割合
• 腸内の菌構成
• 腸内環境の推移(複数回の検査で変化を追える)

結果は、検体がラボに着いてから約3〜4週間後に見られます。

利用者の声は、マイキンソーの口コミを検証した記事で読めます。

見本のような「個別注目菌の割合」のページが自宅キットの結果にあるかは、確認した商品ページに記載がありません。

医療機関向けの見本と、自宅キットの結果画面は、同じと決めつけないほうが安全です。

病院や健診センターの案内に載る項目

病院や健診センターの案内にも、体型に関する項目が載っています。

• SHMCの案内:「ダイエットや美容に関すること(太りやすさ、やせ菌、エクオール産生菌)」
• 東海大学医学部付属病院の案内:「有用菌(ビフィズス菌、やせ菌など)や要注意菌(肥満菌、便秘関連菌など)の保有率も分かります」

SHMCの案内には、管理栄養士からのアドバイスコメントもあります。

ただし、検査会社名や判定の出し方までは書かれていません。

東海大学の案内は2022年のものです。料金や内容は、施設で確認してください。

案内は、SHMCの案内PDFと東海大学の案内PDFで読めます。

他の自宅キットで公式に確認できる範囲

Flora ScanとchatFLORA Gは、公式で確認できる範囲が違います。

Flora Scanの公式トップで読めるのは、次の3点です。

• 腸内フローラを5タイプに分類
• 善玉菌・悪玉菌の割合
• 日本人平均値との比較

「やせ菌」「肥満菌」といった個別の項目名は、公式トップに記載がありません。

Flora Scanとマイキンソーの違いは、目的別に比べた記事もあります。

chatFLORA Gの特徴ページには、レポートが8カテゴリに分かれ、その1つが「ダイエット」だとあります。

解析は「種」レベルまで行う、とも書かれています。

個別の項目名や数値の形は、確認した特徴ページに記載がありません。

ここで挙げた違いは、検査の優劣ではなく、公式ページに書かれている範囲の違いです。

数値の読み方は、「腸内フローラ検査の結果の読み方と判定ラベル」で整理します。

腸内フローラ検査の結果の読み方と判定ラベル

結果は、『割合、良好の範囲、判定ラベル、前回との比較』の4つで読みます。

マイキンソーの2025年作成の見本をもとに、見る場所を整理します。

見る場所	意味	見るときの注意	根拠
結果(割合)	今回検出された菌全体に対する割合	有用菌と要注意菌で望ましい方向が逆	2025年作成の見本
判定値(良好)	良好とされる範囲	男性と女性で判定値が分かれる	2025年作成の見本
判定ラベル	要改善・改善の余地あり・良好	診断ではなく見直しの目安	見本の表紙の注意書き
前回・前々回	過去の結果を並べる欄	前回結果が引き継がれない案内もある	見本と東海大学の2022年の案内

割合は検出された菌全体に対するもの

見本では、各菌の結果が今回検出された腸内細菌全体に対する割合で示されます。

組成の表には、「健常者の中央値」「今回」「前回」「前々回」の列が並びます。

割合を見るときのポイント
・全体に対する割合で示される
・有用菌は十分に保有しているのが望ましい
・要注意菌は多すぎないほうが望ましい

やせ菌は有用菌、肥満菌は要注意菌の中に置かれています。

見本の健常者の中央値は、割合の位置を比べる列として使えます。

良好の範囲と3段階のラベル

各項目の下には、『要改善、改善の余地あり、良好』のラベルが付きます。

良好とされる判定値は、男性と女性で分かれます。

総合判定は、AからEの5段階で示されます。

D・E判定には「バランス崩壊(ディスバイオーシス)が疑われる」という記載があります。

表紙には、診断や治療に直結するものではないと書かれています。ラベルだけで、結果を決めつけないでください。

ラベルは、生活習慣を見直す目安として受け止めるのが安全です。

前回との比較で見えること

見本の結果欄には、前回と前々回の列があります。

表紙には「毎年検査されることをお勧めします」とあります。

マイキンソーの公式ページも、腸内環境の推移を複数回の検査で追えると案内しています。

検査のリニューアルで、前回結果が引き継がれない案内もあります。

東海大学の2022年の案内には、その旨の注意書きがあります。

腸内フローラ検査の受け方と料金と結果までの日数

受け方は、『受け取る、採便する、投函する、結果を見る』の流れです。

マイキンソーの自宅キットは19,800円(税込)で、結果まで約3〜4週間です。

料金と日数を、表にまとめました。

申し込み先	料金(税込)	結果までの日数	確認日・案内の年
マイキンソー(自宅キット)	19,800円	ラボ到着後、約3〜4週間	2026年10月時点
Flora Scan(自宅キット)	1回セット19,800円、2回セット35,640円	ラボ到着後、最大5週間ほど	2026年10月時点
岡山済生会の健診センター	19,800円	最長6週間程度	2022年の案内
東海大学医学部付属病院の健診センター	22,000円	最長6週間程度	2022年の案内
市立伊勢総合病院の健診センター	期間限定の案内のため省略	ポスト投函から4〜6週間	2022年の案内

自宅キットの料金は、2026年10月時点の公式ページの値です。

病院の例は、2022年の案内の値です。

自宅キットで申し込む

マイキンソーの公式ストアには、検査キット「¥19,800(税込)」と表示されています。

Flora Scanの公式トップには、1回セットと2回セットの料金があります。

chatFLORA Gは、確認した公式トップと特徴ページに、料金と結果までの日数の記載がありません。

chatFLORA Gを実際に使った人の流れは、体験記にまとめています。

割引や定期便の価格は時期で変わるため、公式ストアで確認してください。

各社の割引の仕組みは、クーポンをまとめた記事で比べられます。

キットを選ぶときに見る点
・料金(税込)
・結果までの日数
・日数をどこから数えるか

病院や健診センターのオプションで受ける

病院や健診センターでは、健診のオプションとして案内する施設があります。

岡山済生会の2022年の案内には、健診当日に検査キットを渡し、最長6週間程度で結果を送るとあります。

市立伊勢総合病院の2026年3月版の案内には、「16歳以上の方であればどなたでも検査可能です」とあります。

現在の料金と内容は、申し込む施設で確かめてください。

申し込みから結果までの流れ

日数は、案内ごとに数え始めが違います。

• マイキンソー:検体がラボに到着してから、約3〜4週間
• Flora Scan:検査キットがラボに到着してから、最大5週間ほど
• 市立伊勢総合病院(2022年の案内):ポスト投函から、4〜6週間

投函から数える案内と、ラボ到着から数える案内は、『同じ物差しでは比べられません』。

腸内フローラ検査の採便前の注意と避ける時期

市立伊勢総合病院の案内では、『抗生物質の服用中と生理中は採便を控える』とされています。

注意	理由や条件	この施設の案内では
抗生物質	服用中は控え、服用終了後は1ヶ月程度あける	市立伊勢総合病院の2022年の案内
生理中	採便を控える	市立伊勢総合病院の2022年の案内
便の状態	固い便や水様便でも検査は可能	市立伊勢総合病院の2022年の案内
前日の食事	ほとんど影響しない	市立伊勢総合病院の2022年の案内

返送は、マイキンソーの場合採便後1週間以内です。

Flora Scanの採便の注意には、血液の混入を避けることと、水との接触を避けることがあります。

抗生物質の服用中と生理中は避ける

市立伊勢総合病院の2022年の案内には、抗生物質を服用した場合は、服用終了後、1ヶ月程度あけて採便するとあります。

生理中も、採便を控える対象です。

同じ病院の2026年3月版の案内には、バリウムや下剤の服用直後も控える時期として書かれています。

検査の日程は、自己判断で決めないでください。薬の服用については、医師の指示を優先してください。

前日の食事は変えなくてよい

同じ案内では、前日の食事は「ほとんど影響及ぼしません」とされています。

「日頃の食生活のまま」検査を受けることがすすめられています。

便の状態は、できるだけいつもと同じ状態が望ましいとされています。

この内容は1つの施設の案内です。受ける検査の案内もあわせて確認してください。

腸内フローラ検査の結果を受けた食事と運動の見直し方

結果は、『食事や運動を見直すヒント』として使います。

見本は、アドバイスのみで疾患の予防・改善を保証するものではないと断っています。

レポートの改善アドバイスはどんな系統か

2025年作成の見本には、結果別の改善ポイントが付いています。

レポートの記載	対応づけられている区分	根拠
果物の摂取(1日1品が理想的な習慣)	有用菌・要注意菌の両方	結果見本(2025年2月作成)
運動(週に60分以上)	有用菌	結果見本(2025年2月作成)
玄米雑穀米の摂取	有用菌・要注意菌の両方	結果見本(2025年2月作成)
ヨーグルト・乳酸菌飲料の摂取	要注意菌	結果見本(2025年2月作成)

運動には、「週に60分以上運動している人ほど菌叢が安定傾向」というマイキンソーのデータが添えられています。

玄米や雑穀米は、未精製穀物に食物繊維が精製穀物より多く含まれると説明されています。

ヨーグルトや乳酸菌飲料は、「腸内に定着しない傾向がある」ため、継続的に摂るよう書かれています。

これは効果の約束ではなく、見直しの方向を示す欄です。

食べ方と動き方は結果を見ながら少しずつ

食事の目安は、厚生労働省の日本人の食事摂取基準(2025年版)で確認できます。

使用期間は、令和7年度から令和11年度の5年間です。

食物繊維の目標量の解説は、協会けんぽ大阪支部のページにあります。

見直しの進め方
・結果の項目を1つか2つに絞る
・食事と運動を一度に変えすぎない
・再検査で割合の変化を見る

気になる症状があるときは、医療機関を受診してください。

再検査は半年から1年に1回が目安

再検査の目安は、案内によって書き方が違います。

案内元	再検査の目安	案内の言い方
市立伊勢総合病院(2022年の案内)	半年に1回から1年に1回	「望ましいです」
東海大学医学部付属病院(2022年の案内)	1年に1度	「受けませんか」
岡山済生会の健診センター(2022年の案内)	1年に1度	「受けませんか」
マイキンソーの結果見本(2025年作成)	毎年	「お勧めします」

4つの案内を並べると、『半年から1年に1回』の範囲に収まります。

腸内フローラ検査とダイエットのよくある質問

特に確認しておきたい3点
① 体重を変える検査ではありません
② やせ菌の指す菌は見本の作成年で違います
③ 採便前は抗生物質と生理の時期を確認

腸内フローラ検査でダイエットに関係する何が分かる？

体型に関係するとされる菌の割合です。体重の変化は分かりません。詳細は「分かること」へ。

腸内フローラ検査で痩せ菌は分かる？

検査と見本で指す菌が違います。2025年作成の見本はクリステンセネラです。詳細は「やせ菌と肥満菌」へ。

検査を受ければ体重は変わる？

見本は、改善を保証するものではないと断っています。詳細は「体重の変化を約束する検査ではない」へ。

肥満菌が多いと出たらどうすればいい？

診断ではなく、見直しの目安です。気になる症状は医療機関へ。詳細は「食事と運動の見直し方」へ。

再検査はどのくらいの間隔で受ける？

市立伊勢総合病院の2022年の案内は、半年に1回から1年に1回が望ましいとしています。詳細は「再検査の目安」へ。

抗生物質を飲んだあとはいつ検査できる？

市立伊勢総合病院の案内は、服用終了後に1ヶ月程度あけるとしています。詳細は「抗生物質の服用中と生理中」へ。

検査の前に食事から見直したい方へ

腸内フローラ検査を申し込む前の最終チェック

結論は、『検査は体質を数値で確認し、見直しのヒントを得るためのもの』です。

申し込む前は、『見本の作成年と項目名』まで確かめるのが大切です。

目的	見る節	確認すること
体型に関係する項目を数値で見たい	やせ菌と肥満菌とは？	見本の作成年と項目名の違い
料金と日数を先に確かめたい	受け方と料金と日数	料金(税込)と日数の数え始め
病院で相談しながら受けたい	病院や健診センターの案内	案内の年と現在の料金・内容

各社の比較や口コミは、別の記事で整理しています。

検査キットを横並びで選びたい方は、おすすめ5社の比較記事が参考になります。

※本記事の情報は2026年10月時点のものです。最新の情報は各公式ページでご確認ください。